A Faculdade de Medicina tem aberto, anualmente, candidaturas ao Mestrado em Epidemiologia, já na sua 11ª edição. Também aguarda a acreditação para poder oferecer o Mestrado em Epidemiologia em versão integralmente à distância.
Cada aluno poderá candidatar-se ao Mestrado em Epidemiologia. Com a admissão ao Mestrado, o aluno poderá o reconhecimento dos créditos obtidos no Curso de Especialização em Epidemiologia e, reunindo ou completando pelo menos 48 créditos necessários, poderá inscrever-se no segundo ano do Mestrado de Epidemiologia, realizando a sua dissertação de mestrado.